seo中什么叫补充材料，seo内部优化包括哪些内容

　　　　seo中什么叫补充材料，seo内部优化包括哪些内容

　　　　可以看到比值相差很大，**.com网站，大部分页面都被列为补充材料，导致整个网站的竞争力下降。除了检查你的网站有没有造成补充材料的这些原因以外，链接可能会帮助很大。不过刚刚据国外媒体报道，总结了一些网友的观察结果，最终能够把站点的补充材料集中显示出来。

　　　　在假定不同样本中RNA的总体分布一致的前提下，RPKM可以正确处理由于转录本长度和测序深度引起的artifact，从而使得来自不同基因、不同sequencing run乃至不同样本之间的表达数据彼此之间可以比较，第二：有时候已经被删除的网页，也就是实际上应该返回404错误的URL，会被列为补充材料。

　　　　例如，我们假定从基因组上的三个exon可以转录出两个转录本t1与t2 同时，每个exon表达水平在归一化后可以确定为e1=20, e2=40, e3=60 那么，根据转录本的结构，我们可以直接得到转录本表达水平与exon表达水平的关系。

　　　　如果是按照bowtie或者BWA的方法的话，它会在这3个中任意选出一个转录本，把它帖上去，就像是这样，这个读段在这3条转录本中都出现了，最后我们可能，如果根据BWA的结果来看它的话，可能就是错误的结果。如果没有-u，Cufflinks只会把这些reads简单地平均分配。把你的文献名粘贴到谷歌学术搜索（注意是）搜索，如下图所示2、注意所查文献下方引用的链接，点击。

　　　　首先Cufflinks会去找那些不可能出现在同一个转录本中的片段(fragment) 比如说这里黄色和蓝色的片段，它们就不可能出现在同一个转录本里。对于内容页面，将keywords，description设置和标题一样，去掉网站说明。

　　　　下面介绍一下cuffdiff中重要的命令行选项-u 命令指Cuffdiff对回贴到基因组中多个位置的read进行一个初步估计，然后加权分配到各个基因组位置而不是简单地平均分配，其功能与Cufflinks中的u命令相同，这里不再重复讲述。例如，exon1只在转录本1中出现，那么它的所有的表达就完全由转录本1来贡献；0 类似的，exon3在转录本1和2中同时出现，因此这两个转录本都对其表达有贡献。

　　　　下面介绍一下Cuffmerge中重要的命令行选项：06 -g参数指向参考注释GTF文件07 -p参数决定线程数，s 参数指向基因组DNA序列。当我们拿出以上这些结果的时候，我们可能会拿到一个gene list，然后我们可以根据这个gene list做GO或者pathway的分析。